Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms