Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL6Q6ICC9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms