Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms