Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518.8 ms