Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BROXQ5VW32 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms