Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDZK1Q5T2W1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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