Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms