Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms