Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms