Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms