Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms