Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP6Q16828 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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