Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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