Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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