Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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