Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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