Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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