Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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