Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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