Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms