Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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