Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms