Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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