Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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