Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CBFBQ13951 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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