Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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