Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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