Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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