Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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