Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms