Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP1-1Q07627 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms