Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FMODQ06828 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FMODQ06828 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms