Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TCEAL1-202ENST00000372625 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC009088.1-201ENST00000565152 833 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PGGT1BP1-201ENST00000455321 1023 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms