Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms