Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6Q03468 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms