Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms