Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms