Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms