Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H3F3AP84243 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H3F3AP84243 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H3F3AP84243 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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H3F3AP84243 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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