Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL7P80098 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL7P80098 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL7P80098 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL7P80098 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms