Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFM1P61960 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFM1P61960 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFM1P61960 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms