Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01547P58512 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms