Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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