Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC13P55735 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC13P55735 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC13P55735 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC13P55735 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC13P55735 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC13P55735 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms