Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms