Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms