Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERFP50548 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERFP50548 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERFP50548 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms