Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTBP49356 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTBP49356 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms