Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPIAP49247 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPIAP49247 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPIAP49247 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms