Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD2P49005 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD2P49005 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD2P49005 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD2P49005 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD2P49005 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms